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Perlインターフェースは C インターフェース全ての機能を提供しています。 Perl インターフェース ( http://www.unidata.ucar.edu/packages/NetCDF-perl/ ) は配列や文字列に関して Perlの規約に従っています。異なる言語インターフェースを使用して書かれたデータのディスク上のフォーマットは同じである。C言語のプログラムで書かれたデータはPerl プログラムから読むことが出来、又、逆も可能である。